Dalam upaya mewujudkan penataan organisasi di Politeknik Perkapalan Negeri Surabaya guna mewujudkan efisiensi, efektivitas, berhasil guna dan berdaya guna dalam mentransformasikan dan merefleksikan setiap tugas dan fungsi yang diemban diperlukan penataan organisasi. Salah satu prioritas kegiatan reformasi birokrasi di bidang ketatalaksanaan yaitu melakukan analisis jabatan yang hasilnya berupa Uraian Jabatan termasuk didalamnya spesifikasi atau syarat jabatan, Peta Jabatan dan selanjutnya bersama-sama dengan Analisis Beban Kerja dapat disusun jumlah kebutuhan pegawai per Unit Kerja.
Berdasarkan pedoman pelaksanaan analisis jabatan di lingkungan Kementerian Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi, setiap Unit Kerja di lingkungan Kementerian harus melaksanakan analisis jabatan dan secara konsisten memanfaatkan hasil analisis jabatan untuk pengelolaan kepegawaian, organisasi, serta menjadikan analisis jabatan sebagai umpan balik dalam penguatan aspek pengawasan dan akuntabilitas.